二氧化碳培養箱溫度加熱方式一般分水套式和氣套式。水套式適合實驗環境不太穩定（如有用電限制或經常停電）的用戶選用，氣套式特別有利于短期培養以及需要箱門頻繁開關取放樣的培養。此外，對于使用者來說氣套式設計比水套式更簡單化（水套式需要對水箱進行加水、清空和清洗，并要經常監控水箱運作的情況，還有潛在的污染隱患）。

可靠的溫控系統是培養箱*的重要部分。目前市面上主流的溫度傳感器有兩線制和四線制PT100溫度傳感器，其中四線制比兩線制更為。用戶應選用高度的溫度傳感器并且具備相互獨立多重溫度控制功能的二氧化碳培養箱，即箱內溫度控制、高/低溫報警、多重過溫保護等。同時，在選擇氣套式的培養箱時，培養箱內還應裝有風扇以保證箱內空氣的循環和流通，保證箱內的溫度、CO2濃度、相對濕度的專一性。